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原创 eryun 云生信学生物信息学 关注我们
做生物信息的小伙伴们肯定对统计分析不陌生,做统计分析较为常用的就是SPSS和R语言了,但这样不仅得下载软件,如果是R语言的话还需要复制代码,很是麻烦,而且就是得到结果,想要可视化还得手动画图。那么有没有可以一键分析加画图的在线工具呢,当然有了,这就是我们今天的主角——SPSSAU。
神器可以做线性回归,方差齐检验,t 检验,单样本t 检验,配对t 检验,正态性检验,非参数检验,小云在这里用卡方检验为例介绍:
SPSSAU的网址为https://spssau.com/,首页如下
进入SPSS,右上角登录,然后上传数据
点击上传数据,有多种格式可选,我们一般是用电子表格excel的格式
选择好数据后,就进入了数据预览阶段,在这里你可以预览你的数据
小云的数据有三列,第一列是样本号,第二列是癌症发生的阶段,有四个阶段,为方便比较,我进行了合并,一和二阶段一组,三和四阶段一组,第三列是根据基因表达量进行无监督聚类得到的亚型分组,后两列就是我们需要检验的数据了。
在左侧的工具栏中选择卡方检验
点击进入分析,选择要分析的列。
拖动要分析的列到右边,这里X部分拖一个,Y部分拖一个
拖好后就可以开始分析了,因为我们是免费版,只分析前两百行数据,这对于大多数分析来说已经足够用了。
让我们查看一下结果。
P值只有0.06,很遗憾,不显著,但也算比较接近了。
往下翻就可以看到生成的图片
点击样式可以选择不同的配色和图片类型,这些图片和结果都可以直接导出,而且有多种格式可以选择,非常方便。
以上就是SPSSAU做卡方检验的流程了,不知道对小伙伴们是不是有一定的帮助呢?
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